Исчезновение Харухи Судзумии

Приближается середина декабря, и лидер бригады SOS, Судзумия Харухи, объявляет, что Рождество будет отмечаться в клубе с рождественским ужином. Члены SOS бросаются в приготовления, наполняя воздух предпраздничным волнением. Однако, несколько дней спустя, Кён замечает необычные изменения: разговор с Танигути становится непонятным, тот внезапно заболевает и не помнит предыдущего разговора. В классе отсутствует Харухи, а Рёко Асакура занимает её место, ведя себя как ни в чём не бывало.

Микуру Асахина не узнаёт Кёна, а Нагато превращается в обычную девушку, становясь единственным членом литературного клуба. Кён оказывается в мире, где никогда не существовало бригады SOS и самой Харухи. Эти странные изменения заставляют Кёна задуматься о реальности окружающего мира и о том, что же на самом деле происходит. В поисках ответов, он начинает исследовать эти необъяснимые явления, надеясь вернуть всё на свои места.

Тем временем, подготовка к рождественскому ужину продолжается, несмотря на все странности. Кён пытается разобраться в происходящем, одновременно стараясь поддерживать обычный ритм жизни. В этом путешествии через искажённую реальность, Кён понимает, что истина может быть где-то рядом, и что ключ к разгадке лежит в самых неожиданных местах. Вместе с членами клуба, Кён стремится не только вернуть прежнюю реальность, но и понять глубинные смыслы этого странного Рождества.